Sheffield, une équipe de l’université de Stanford découvre des gènes liés au Covid-19

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  • Des scientifiques de l’Université de Sheffield au Royaume-Uni et de l’Université de Stanford aux États-Unis ont identifié certains signaux génétiques chez les individus qui développent une infection sévère au Covid-19.

    L’équipe a tiré parti de l’apprentissage automatique et a découvert plus de 1 000 gènes associés à des cas graves de Covid-19 qui nécessitaient une assistance respiratoire ou étaient mortels.

    De plus, l’équipe a détecté des types spécifiques de cellules dans lesquelles ces gènes agissent.

    Cette recherche est considérée comme l’une des premières études à établir une relation entre les gènes liés au coronavirus et des fonctions biologiques particulières.

    Pour démêler la génétique derrière le Covid-19 sévère, les chercheurs ont utilisé divers grands ensembles de données. Le premier ensemble de données comprenait des informations génétiques provenant de tissus pulmonaires d’humains en bonne santé.

    Ces données ont aidé à détecter l’expression des gènes dans 19 types de cellules pulmonaires distinctes, y compris les cellules épithéliales.

    Ces cellules tapissent les voies respiratoires et constituent la première ligne de défense contre les infections.

    D’autres données proviennent de la COVID-19 Host Genetics Initiative, une étude génétique sur des patients Covid-19 gravement malades.

    L’équipe a analysé des indices génétiques dans les données telles que les mutations de l’ADN connues sous le nom de polymorphismes nucléotidiques simples, qui pourraient montrer si quelqu’un présente un risque accru de Covid-19 sévère.

    Ils ont évalué si certaines mutations se produisaient plus ou moins souvent chez les patients atteints de Covid-19 sévère.

    L’équipe a pu établir quels gènes fonctionnaient mal et dans quels types de cellules en superposant les mutations sur les génomes spécifiques aux cellules.

    De plus, les chercheurs ont découvert que le Covid-19 sévère est principalement lié à une réponse affaiblie de deux cellules immunitaires, les cellules tueuses naturelles (NK) et les cellules T, à l’aide d’un outil d’apprentissage automatique.

    Le Dr Johnathan Cooper-Knock, conférencier clinique du Département de neurosciences de l’Université de Sheffield au NIHR, a déclaré: «Les cellules NK, avec lesquelles les humains naissent et constituent la première ligne de défense du corps contre les infections, sont connues pour leur capacité à détruire les virus et les cellules cancéreuses.

    “Nous avons constaté que chez les personnes atteintes d’une infection grave à coronavirus, les gènes critiques des cellules NK sont moins exprimés, il y a donc une réponse immunitaire moins robuste.”

    Actuellement, les essais de perfusions de cellules NK pour le Covid-19 sévère progressent.

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