L’Université d’Oxford et Oracle Cloud System aident les chercheurs à identifier plus rapidement les variantes de COVID-19

La propagation rapide de la variante Delta hautement infectieuse souligne la nécessité d’une identification plus rapide des mutations COVID-19. Unissant les gouvernements et les communautés médicales dans ce défi, l’Université d’Oxford et le Global Pathogen Analysis System (GPAS) d’Oracle sont désormais utilisés par des organisations sur presque tous les continents. Les institutions utilisant la plateforme comprennent : le Centre de recherche du Centre hospitalier de l’Université de Montréal, l’Institut de recherche en santé publique du Chili, l’Unité de recherche clinique de l’Université d’Oxford au Vietnam, l’Institut de pathologie clinique et de recherche médicale – New South Wales Pathology et Oxford Nanopore Les technologies. Le GPAS fait également désormais partie de la plate-forme d’évaluation des nouvelles variantes de Public Health England.

Le système mondial d’analyse des agents pathogènes est fourni en tant que ressource gratuite pour aider à lutter contre le COVID-19 et d’autres menaces pour la santé microbienne. Rejoignez le programme et apprenez-en plus sur : www.gpas.cloud

Construit à l’aide de la plate-forme Scalable Pathogen Pipeline (SP3) d’Oxford, d’Oracle APEX et d’Oracle Cloud Infrastructure (OCI), le Global Pathogen Analysis System est une plate-forme cloud qui fournit un système unifié et standardisé pour analyser et comparer les données de séquence génomique annotées du SRAS. CoV-2. Les chercheurs utilisent le système pour télécharger des données sur les agents pathogènes et recevoir des résultats complets en quelques minutes. Avec la permission de l’utilisateur, les résultats peuvent être partagés avec les laboratoires participants du monde entier dans un environnement sécurisé. Rendre ces données compréhensibles et partageables aidera les autorités de santé publique à évaluer et à planifier leur réponse en leur donnant un aperçu inestimable des variantes émergentes avant même qu’elles ne soient officiellement désignées comme variantes préoccupantes.

Unir la communauté mondiale de la recherche dans une mission commune

« Le GPAS est le premier service basé sur les normes de l’industrie au monde, offrant un service d’analyse de données de séquence standardisé pour les utilisateurs sur le cloud », a déclaré Derrick Crook, professeur de microbiologie au département de médecine Nuffield de l’Université d’Oxford. « Les utilisateurs pourront accéder, télécharger et traiter leurs données de séquence sous leur contrôle souverain et recevoir en retour des données entièrement analysées en moins de 20 minutes après un téléchargement réussi. S’ils choisissent de partager des données, ils contribueront aux visualisations du tableau de bord électronique de des données mondiales révélant les changements quotidiens dans la progression de la pandémie et l’évolution du virus. Cela permettra une évaluation continue de la pandémie et aidera à orienter les interventions nationales et mondiales pour freiner l’impact du virus.

« COVID-19 est un combat mondial, mais les chercheurs manquaient d’infrastructure technique pour traiter les séquences brutes rapidement, en toute sécurité et partager ces résultats dans le monde entier », a déclaré le président et directeur technique d’Oracle, Larry Ellison. “Avec GPAS, nous apportons la puissance et la sécurité du cloud pour permettre à n’importe quel chercheur, où qu’il soit, de faire partie de la solution. Plus les institutions médicales, les gouvernements et les universitaires fournissent de données, plus rapidement nous pouvons comprendre et agir pour devancer le coronavirus.”

Grâce à la plate-forme, les chercheurs et les gouvernements pourront accéder rapidement aux données pertinentes et opportunes dont ils ont besoin pour effectuer des analyses scientifiques à jour et des décisions politiques et de sécurité mieux informées concernant les nouvelles variantes. Dans le cadre de leur travail avec le Global Health Security Consortium (GHSC), le Lawrence J. Ellison Institute for Transformative Medicine (Ellison Institute) et le Tony Blair Institute (TBI) for Global Change ont travaillé en coordination avec Oxford et Oracle pour soutenir le développement de la plate-forme et de la mettre entre les mains de chercheurs du monde entier.

« Le manque de préparation du monde à la pandémie de COVID-19 a mis en évidence notre besoin de travailler différemment afin d’identifier des solutions pragmatiques et capables d’évoluer face aux défis », a déclaré le Dr David B. Agus, membre et PDG du GHSC. , Institut Ellison. “Le GPAS est un élément clé de l’infrastructure mondiale de données pour les systèmes d’alerte précoce et la surveillance mondiale.”

“Nous ne savons que trop bien que les virus ne respectent pas les frontières, c’est pourquoi nous devons adopter une approche globale et résolue pour contenir cette pandémie”, a déclaré Tony Blair, président exécutif de TBI et ancien Premier ministre britannique. “Cette plate-forme promet de rassembler les données beaucoup plus rapidement, nous aidant à mieux comprendre et à anticiper les schémas de propagation plus rapidement, afin que les gouvernements puissent prendre de meilleures décisions politiques et atténuer l’impact dévastateur que ce virus continue d’infliger dans leur propre pays et à travers le globe.”

Pour participer à cette initiative, rendez-vous sur : www.gpas.cloud

À propos de l’Université d’Oxford

L’Université d’Oxford a été classée numéro 1 dans le classement mondial des universités du Times Higher Education pour la cinquième année consécutive, et au cœur de ce succès se trouve notre recherche et notre innovation révolutionnaires.

Oxford est mondialement connu pour l’excellence de sa recherche et abrite certaines des personnes les plus talentueuses du monde entier. Notre travail aide la vie de millions de personnes, en résolvant des problèmes du monde réel grâce à un vaste réseau de partenariats et de collaborations. L’étendue et la nature interdisciplinaire de nos recherches suscitent des idées et des solutions imaginatives et inventives.

Grâce à sa branche de commercialisation de la recherche, Oxford University Innovation, Oxford est le plus grand déposant de brevets universitaires au Royaume-Uni et est classé premier au Royaume-Uni pour les entreprises dérivées universitaires, ayant créé plus de 200 nouvelles entreprises depuis 1988. Plus d’un tiers de ces entreprises ont été créées. au cours des trois dernières années.

À propos d’Oracle

Oracle propose des suites d’applications intégrées ainsi qu’une infrastructure sécurisée et autonome dans Oracle Cloud.

À propos du Consortium mondial pour la sécurité sanitaire

Le Global Health Security Consortium (GHSC) fournit des informations, des analyses et un soutien aux dirigeants du monde entier pour les aider à faire face au COVID-19 aujourd’hui et à se préparer aux défis de la sécurité sanitaire de demain. Il s’agit d’une initiative conjointe du Tony Blair Institute for Global Change, de l’Ellison Institute for Transformative Medicine et d’une équipe de scientifiques de l’Université d’Oxford.